توضیحات:تحقیق تکنیک CDNA-AFLP و معرفی پایگاه های داده برای مقایسه توالی های RNA با دو فرمت ورد و pdf.
قسمت هایی از متن
معرفی تکنیک cDNA-AFLP
cDNA-AFLPیک روش بسیار کارآمد انگشت نگاریRNA برای جداسازی ژن هایی است که به صورت متمایز بیان می شوند (Bachem et al., 1996, 1998). این روش یک روش تجزیه و تحلیل بیان به صورت گسترده در ژنوم است که نیاز به اطلاعات قبلی توالی ندارد که آن را تبدیل به یک ابزار عالی برای کشف ژن می کند .(Ditt et al., 2001) روش قدیمی شامل چهار مرحله ی اصلی است ...
فهرست مطالب:1-مقدمه
2-معرفی تکنیک- cDNA-AFLP
3-سیستم های cDNA-AFLP برای کشف ژن استفاده می شود
4-همترازی خوانش با یک ژنوم مرجع
5-برنامه های همترازسازی
6-Bowtie
7- TopHat
8-STAR
9- معرفی پایگاه های داده برای مقایسه و همترازی توالی های RNA
10- توالی در مقابل پایگاه داده های هم ترازسازی
11- پایگاه های همترازی عمومی Rfam
12- وب سایت مقایسه ای RNA (CRW)
13- وب tmRNA
14- پایگاه داده SRPDB
14- پایگاه داده tmRDB
15- برنامه ERPIN
16- پایگاه داده sno/scaRNAbase
17- پایگاه داده tRNAdb
18- وبسایت SILVA
19- پایگاه داده های ریبوزومی RDP
20- پایگاه داده توالی Ribonuclease P..